在有两个小孩的离婚案件中，抚养权的分配主要依据《中华人民共和国民法典》的相关规定。以下是可能的分配方式：
协商一致
如果夫妻双方能够就孩子的抚养权达成一致意见，例如一方抚养一个孩子，那么法庭通常会尊重双方的意愿，并按照双方的协议出具判决书。
法院判决
如果夫妻双方无法就孩子的抚养权协商一致，法院会根据一系列因素进行判决，这些因素包括：
孩子的年龄和性别；
父母的抚养能力和经济条件；
孩子的意愿（特别是对于八周岁以上的孩子）；
孩子的健康和生活习惯；
父母是否有不利于抚养孩子的情况，如重大疾病或不良嗜好。
具体案例说明：
案例一：假设一对夫妻离婚，一个五岁，一个十岁。如果双方不能就抚养问题达成一致，法院可能会判决父亲抚养五岁的孩子，母亲抚养十岁的孩子。这是因为父亲的经济条件更好，能提供更好的物质生活和教育环境，而十岁的孩子更愿意跟母亲生活。
案例二：如果两个孩子都在两周岁以下，法院通常会优先考虑由母亲抚养，除非母亲存在特殊情况，如健康问题或无法履行抚养义务。
案例三：对于八周岁以上的孩子，法院会尊重孩子的真实意愿，但在父母双方条件相当的情况下，法院也会综合考虑其他因素，如抚养能力和条件。
抚养费问题：
离婚后，一方抚养的子女，另一方应负担必要的生活费和教育费的一部或全部。抚养费的数额和期限由双方协议，协议不成时由法院判决。有固定收入的，抚养费一般可按其月总收入的20%至30%的比例给付，负担两个以上子女抚养费的，比例可适当提高，但一般不得超过月总收入的50%。
建议：
父母在离婚时，应尽量通过协商达成一致意见，以减少诉讼带来的时间和精力消耗。
如果协商无果，应尽早寻求专业律师的帮助，以便在法庭上更好地维护自己和孩子的权益。
在抚养权的分配上，应充分考虑孩子的最大利益，包括身心健康、教育环境和家庭稳定等方面。