公司不能简易注销的原因主要包括以下几点：
未结清债权债务：
如果公司在申请简易注销登记时，没有结清清偿费用、职工工资、社会保险费用、法定补偿金、应缴纳税款（包括滞纳金、罚款）等债权债务，则不能采取简易注销。
工商异常：
公司如果在经营过程中出现未按时提交年度报告、擅自搬迁地址未做变更等工商异常情况，将无法直接办理简易注销。
风险纳税人：
若公司被认定为风险纳税人，例如存在逾期纳税申报、错误申报、长期零申报或发票问题等，也不能直接办理简易注销。
存在分支机构：
规模较大的公司如果设有分支机构，必须先注销分支机构才能注销总公司，这增加了注销的复杂性和时间成本。
未办理法定义务：
包括未依法办理所得税清算申报或有清算所得未缴纳所得税、正在被立案调查或采取行政强制、司法协助、受到罚款等行政处罚尚未执行完毕等情形，都不适用简易注销程序。
其他特定情形：
如涉及国家规定实施准入特别管理措施的外商投资企业、被列入企业异常经营名录或严重违法失信企业名单、股权被冻结或出质、正在被立案或采取行政强制、企业所属非法人分支机构未办理注销登记等，均不能简易注销。
法律或行政法规限制：
法律、行政法规或者国务院规定在注销登记前须经批准的，或者企业进入行政复议、诉讼或者仲裁程序的，也不适用简易注销登记。
综上所述，公司在申请简易注销时必须确保所有相关债权债务已结清，无工商和税务方面的异常及处罚记录，且不存在其他特定情形和法律限制。只有满足这些条件，公司才能顺利进行简易注销。