在民事诉讼中，被告的举证责任主要是反驳原告的主张，具体可以采取以下几种方式：
反驳证据：
被告可以使用反驳证据来质疑原告提供的证据的真实性和合法性。
反证：
被告可以提供反证来证明原告的主张不成立。
新的本证：
被告可以提出新的证据来支持自己的主张或反驳原告的主张。
此外，被告还需要遵循法院的举证通知书要求，并在规定的举证期限内提交证据。如果被告未能按时提供证据且无正当理由，可能会承担不利的法律后果。
在行政诉讼中，被告的举证责任有所不同：
具体行政行为的合法性：
被告需承担具体行政行为合法性方面的举证责任，包括事实依据和法律依据。
起诉期限：
若被告对原告的起诉期限有争议，则被告需承担举证责任。
总结：
民事诉讼：被告主要通过反驳证据、反证和新的本证来举证，需遵循法院的举证通知书要求。
行政诉讼：被告需承担具体行政行为的合法性举证责任，并对起诉期限有争议时负有举证责任。