生态养殖需要办理的证件主要包括以下几项：
养殖许可证：
根据《畜牧业法》和《养殖场（基地）管理规定》，从事畜禽养殖业活动的单位和个人必须申请养殖许可证。
动物防疫条件合格证：
养殖户在畜禽购入前需要进行检疫，检疫合格后需向当地动物疫病防治机构申请该证，并在动物生命周期中定期进行检疫。
工商营业执照：
养殖户需凭动物防疫合格证到工商行政管理局登记注册，取得营业执照。
税务登记证：
养殖企业在建成后需要到县行政服务中心办理税务登记证。
法人代码证：
同样需要在县行政服务中心办理法人代码证。
排污许可证：
在依法实施污染物排放总量控制的区域内，畜禽养殖场必须取得《排污许可证》，并按照其规定排放污染物。
环保批文：
养殖户必须确保其养殖场符合环境保护要求，否则可能会被行政部门责令关闭。
安全生产许可证：
特别是对于生产具有安全隐患的产品的养殖场，在生产开展之前必须申请该证。
养殖场备案登记手续：
在取得营业执照后，养殖户需要到畜牧局办理养殖场备案登记手续。
特种养殖证：
如果养殖的是野生动物，还需要到林业局办理特种养殖证。
建议养殖者在进行生态养殖前，详细了解并准备好所有必要的证件和手续，以确保养殖活动合法合规，避免因证件不全而受到处罚。