申请特殊病种救助的步骤如下：
确诊并获取医疗证明
患者需要确诊为特殊病种，并获得相关的医疗证明文件，如病历、诊断证明、检查报告等。
咨询当地相关部门
患者可以向当地卫生部门或社会保障机构咨询申请补助的具体流程和所需材料。通常需要填写申请表格，并提供医疗证明、个人身份证明等文件。
准备申请材料
携带既往病史资料至门诊医生就诊，符合条件的患者，由医生填写基本医疗保险特殊病种证明及门诊治疗审批表。特殊病种审批表必须由二级以上定点医疗机构经治医师填写。
患者或家属需携带病史资料、医保卡、身份证（未成年人持户口本）和1寸照片2张及以上到医院相关病史资料到户籍所在地的社保所申请，领取并填写申请表，审批表到当地社保局审批并盖章。
提交申请
患者或家属可以携带准备好的材料前往当地医保经办机构提出申请，有些地区也支持在定点医疗机构的医保窗口进行申请。在医院办理时，患者或家属先向医生咨询特殊病种的相关信息，了解办理条件和流程，然后准备病历资料、检查报告、诊断证明等相关资料，到医院医保办或特殊病种办理窗口填写申请表，并提交相关资料。工作人员对申请资料进行审核，如符合条件，则审批通过；如不符合条件，则审批不通过，并告知原因。
审核与批准
医保部门会对提交的材料进行审核，确定患者是否符合特殊疾病的条件。审核通过后，患者就可以享受特殊病种医保待遇，医保部门会发放特殊疾病就诊证或批准文件等。
异地就医人员申请
异地就医人员可以通过登录当地医保部门的官方网站或者手机 APP，在服务大厅或者业务办理模块中找到慢性疾病和特殊疾病待遇申请的选项，按照提示填写个人信息，包括姓名、身份证号码、联系方式等，并上传相关证明材料，如医院诊断证明、病历资料、检查报告等，最后提交申请，等待审核。
建议患者在申请过程中详细咨询当地相关部门，确保所有材料的真实性和完整性，以便顺利完成申请。