挂靠公司结账的步骤如下：
签订协议
挂靠人与被挂靠公司签订协议，明确双方的权利和义务。
支付费用
挂靠人将工作成果或服务费用通过银行转账或支票等形式支付给被挂靠公司。
记入账户
被挂靠公司按照协议约定，将相应金额记入挂靠人的账户。
领取工资或报销费用
挂靠人从被挂靠公司领取工资或报销费用。
纳税申报
被挂靠公司按照国家税收法规进行纳税申报。
财务账目清晰
双方应确保财务账目清晰，符合国家财务管理制度。
资金合法合规
在整个过程中，双方应确保资金的合法合规，避免出现违法违规行为。
此外，对于挂靠工程的会计处理，还有一些具体的注意事项：
会计核算主体：以被挂靠方为会计核算主体，不能以挂靠方为会计核算主体。
项目部专属账户：被挂靠方项目部专属账户收到挂靠方存入的购买建筑材料时，应记入“银行存款”和“其他应付款”科目。
预付款处理：被挂靠方收到业主预付工程款时，应记入“银行存款”和“预收账款”科目，并按规定计算销项税额。
工程完工结算：工程完工后，被挂靠方应结转收入、结转税金，并将相关款项支付给挂靠人。
成本核算：挂靠人应提供劳务发票或材料发票，被挂靠方根据发票入账，并在完工后结转施工成本。
通过以上步骤和注意事项，挂靠公司可以规范地进行结账工作，确保双方财务清晰、合法合规。