发票作废的主要原因包括：
开具错误：
当开票人员在开具发票时发生填错的情况，需要重新开具发票，此时可以在原发票上标明“作废”的字样。
退货或退款：
如果用票企业或个人在开具发票后发生退货，可以收回原发票，并注明“作废”字样。
销售折让：
在发生销售折让的情况下，可以收回原发票，并注明“作废”字样，然后重新开具销售发票。
恶意隐瞒收入：
纳税人可能通过将已开具发票作废，下月重开，将当月发票开具金额降入起征点以下，从而达到不上税的目的。
恶意串通：
销售方与接票方在有真实业务的前提下恶意串通，销售方违规作废部分发票，接票方虚列成本，以达到偷税目的。
涉嫌虚开发票：
部分企业涉嫌虚开发票，为了避免被税务机关发现，将部分发票进行作废，以平销、微利达到虚开发票的目的。
发票损坏：
发票在开具过程中可能发生损坏，需要作废并重新开具。
发票遗失：
发票在保管过程中可能遗失，需要作废并重新开具。
应税服务中止：
例如装修到一半不装了，需要作废相应的发票。
空白发票作废：
为规避注销后的恶意使用，一般情况下，要求公司在税务注销时作废空白发票。
错误开票：
在开具电子专用发票的过程中，如果发生错误，例如填写了错误的金额、税率或其他信息，需要及时作废该发票并重新开具正确的发票。
销售合同取消：
如果销售合同被取消或终止，相应的电子专用发票也需要作废。
销售凭证作废：
如果销售凭证（如销售订单、发货单等）被作废，相应的电子专用发票也需要作废。
纳税义务终止：
如果纳税人的纳税义务终止（如企业注销、破产等），需要作废该纳税人开具的所有电子专用发票。
其他原因：
根据实际情况，还可能存在其他需要作废电子专用发票的原因，如发票被盗用、发票信息被篡改等。
综上所述，发票作废的原因多种多样，既有正常的经营活动中的退货、退款、销售折让等，也有恶意隐瞒收入、虚开发票等违法行为。在实际操作中，企业和个人应当严格遵守相关税收法规，确保发票的合法性和真实性。